サクラ100ゲノムII

ゲノム情報を接点に 日本の生物多様性とサクラ文化を探る

サクラマップ

GBIFポータルで公開されているサクラのオカレンスをマップに表示しています。

オカレンスデータの取得について

サクラのオカレンスマップは、GBIF APIを利用して桜のtaxonKeyをもとに作成しています。 taxonKeyはGBIFにおいて各taxonに個別に付けられている番号で、 たとえばPlantaeのtaxonKeyは6、 Cerasus speciosa (Koidz.) H.OhbaのtaxonKeyは3021432です。

このサイトから公開しているサクラを対象に、それぞれの学名から該当するtaxonKeyをGBIF.orgで調べ、マップに使用しました。また、学名が何らかの学名のシノニムであるとされている場合には、アクセプトされている学名のtaxonKeyを使用しました。

クリックすると拡大します。

1. データベースから「Latin name」「論文用英語名」「学名」の情報を抽出します。
2. 命名者の部分がある場合は削除し、検索用学名を決定します。
3. GBIF.orgで検索用学名を検索します。
4. 検索用学名と一致する学名を選択します。
5. 選択した学名Xがシノニムかどうかを確認し、シノニムでない場合は学名XのtaxonIDをマップに使用します。
6. 学名Xが何らかの学名Yのシノニムである場合は、学名YのtaxonIDをマップに使用します。この場合、学名Yのオカレンス情報には学名Xのオカレンス情報が含まれます。

マップデータ取得に使用した学名とtaxonKeyの一覧